该剧改编自步月浅妆的小说《权宠之仵作医妃》，讲述大理寺卿沈毅因卷入晋王案，全家惨遭灭门，其女沈莞借用秦府九娘子秦莞的身份逃到荆州。原本柔弱可欺的秦莞“性情大变”，不仅会治病救人，还能剖尸探案，顺带将秦府的伯母庶妹姨娘刁奴治得服服帖帖。探案期间秦结识了睿王世子燕迟，燕迟一心为晋王翻案，与秦莞为父昭雪的目标不谋而合，二人一起回京，途中联手破获了各式诡谲大案。回京后，一具意外发现的骸骨让晋王案得以重提，燕迟和秦莞一起慢慢接近了案件的真相，发现了皇宫里深藏的惊天秘密。
1944年伪满统治下的哈尔滨，伪装成铁路巡警的地下党宋卓文（秦昊 饰），被特务科科长关雪（杨幂 饰）误认为自己的救命恩人——其实是卓文失散多年的双胞胎哥哥宋卓武（秦昊 饰）。卓文为查清关东军课长浅野大吾来哈尔滨的最高任务，将计就计利用关雪进入特务科，可是宋卓武却突然出现，使卓文陷入始料未及的困境。关雪冷血多疑，心狠毒辣，卓武生性冲动，经常无意间破坏卓文的行动，在上级的安排下，才使得两兄弟相互配合，彼此掩护，经历数次的试探，避开特务科内部同事的明争暗斗，终于取得关雪和日方高官的信任。在这短短一年的时间之内，地下党人们经历千辛万苦查清并阻止了日军和苏联共谋的秘密行动，揪出潜伏在我党内部的伪满特务，迎来战争最后的胜利。
1927年国共两党合作破裂后，年轻的中国共产党组织了南昌起义、秋收起义，并在井冈山开辟了革命根据地，创建了人民军队。随后，转战闽西，历经血与火的考验和不断探索，终于在古田会议上确定了思想建党、政治建军的伟大原则。第五次反围剿失败后，红军开始了二万五千里长征。长征路上，红军历经艰难险阻，冲过四道封锁线，血战湘江，突破乌江。在中国革命面临生死存亡的紧要关头，毛泽东力挽狂澜，与周恩来、朱德、张闻天、王稼祥等老一辈无产阶级革命家一同于1935年1月15日召开了遵义会议，中国革命历经了伟大的转折，开创了中国革命胜利的伟大征程。
1939年，抗日战争转入艰苦的相持阶段，日寇侵略的铁蹄在湖南战场受阻，湖南成为抗日战争正面战场的最前沿。 中共党员童莲受党组织委托，以湖南省抗战救亡慈善总会工作人员的公开身份为掩护，承担了开辟由重庆后方经湘西雪峰山区，向湖南前线运送抗战物资的地下秘密运输线的特殊任务。 湘西雪峰山下，以麻溪铺镇为中心，方圆数十里，古称“竿子营”，是九弓十七寨“竿民”世代居住的地方。开榨油坊的田大有带着女儿穗穗，在这里过着平静祥和的山民生活。 麻溪铺迎来了盛大的端午节，龙舟比赛上，穗穗与青年石三怒一见钟情，而麻溪铺镇镇长龙太爷的两个孙子龙耀武与龙耀文也分别喜欢上了穗穗。穗穗却没有想到，石三怒是与竿子营世代冤家的排帮首领麻大拐子的义子。 就在这一天，童莲护送抗战救济物资经过麻溪铺，遭到排帮抢劫，幸得田大有相救，麻大拐子却因此认出了田大有正是十六年前杀死义兄石天保的仇人，他...
