谢看花即将被上林天宫处决，在苏白衣一行人援救过程中，上林天宫解体，苏白衣被幽狱中自困二十年的魔君苏戬带走。轩唯城英雄大会再度召开，白极乐以“天地同悲”面具引诱天下第二高手薛神官前往，江湖大乱。苏白衣为救负伤的南宫夕儿，与苏戬去往北昆仑求见苏家老祖苏锁莫，谢羽灵、风左君则纷纷前往青城山和恶魔城学习武艺。暗流涌动中，瀛洲仙岛再现，瀛洲来客向武林人士发下挑衅，顺者昌、逆者亡......
天才脑科学家白月魁为救恩师霍恩进行了脑移植术，却不想霍恩受到西弗残存意识的影响......琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。同一时间，久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱，市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降，却不想等到一切尘埃落定之时，真正的末日却来临了……
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
