立下赫赫战功的北境大将军裴旻，因莫须有之罪名，被满门抄斩。在西岭籍籍无名的草根少年宁奕，机缘巧合，救下了将军府唯一的幸存者，裴旻的女儿，自此一大一小，兄妹二人，艰难求生。 三位皇子争夺皇位，以天下为棋局，众生为棋子。宁奕带着“妹妹”走入天都皇城。在这场乱局之中，他要求生， 便必须从“棋子”的身份，跳脱出来，成为“棋手”。宁奕别无依靠，唯有一把剑。
本是小镇一介普通少年郎的独孤败天，一心寻求武学真谛，却为人算计遭受情劫，被迫卷入武林纷争，因魔的身份为世人所误解，为了生存苦苦挣扎，逐渐觉醒前世记忆，走向一条抗天之路，并在此过程中收获最真诚的友情和最可贵的爱情。即使历经千劫万险，纵使魂飞魄散，依旧保持初心，为自己、为命运、为正义而战，无论对手如何强大，他也从未退缩。
蓝星大陆遭受磁场风暴，导致环境剧变，灵气复苏。在天地灵气的滋养下，人类和动物的各项身体机能被无限激发，历经漫长的岁月洗礼，形成了灵兽和人类常年对峙，争夺生存空间的紧张局面。为了保护家园，人类不断发展科技与新型修炼体系，成立作战联盟，大力培养战斗型人才。少年凌天是初级学府琼海战校年轻一辈中的佼佼者，他拥有罕见的古神血脉，身怀神秘至宝“神脑”。一天，凌天从来自未来的助手炎灵口中，得知了三年后，大陆将面临一场重大劫难，自己也会在这场劫难中壮烈牺牲。自此之后，凌天为了人类的未来，听从炎灵的建议，决心在三年内修炼至巅峰境界，改变一切。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
