1999年的东京，一部军用的机械人在无人的情况自动启动、一个名为帆场瑛一的篠原重工天才程序员自杀；谁也没想到，两起无关事件却会在将来把东京带入恐怖中。从建筑施工现场到人们的日常生活，处处都可以见到一种被称为“Labor”的大型机器人。面对Labor相关犯罪与日俱增的局面，警察局成立了特殊车辆二课，配备专门机器人PatLabor，负责处理特殊事务。Labor到了更新换代的时期，作为机器人大脑的电脑操作系统升级为HOS。正在这时，突然发生多起机器人失控事件，机动警察小队负责调查此事。他们发现这是由与HOS有关的电脑病毒所导致的，而肇事者已经销毁了所有资料行踪不明。在东京湾，制造巨型海上方舟以解决东京土地问题的巴比伦计划已经到了关键时刻，那里集结了全国45%的Labor机器人，这些机器人一旦失控后果将不堪设想…… 　　本片为TV动画《机动警察》的剧场版。

正在调查坠落在太平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，导致遗传因子标准的变质，变成了凶恶的怪兽THE ONE。之后，他（THE ONE）从防卫厅内的特殊机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。　　另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了多点时间陪伴患有先天性疾病的儿子继梦决定辞去官职。在最后一次飞行中真木与“红色发光体”在空中相遇。这是the one事件后3个月发生的事情。但是真木奇迹般地生还，然后转职成为了民航机飞行员，展开了新生活。对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担当官水原沙罗，BCST将真木强制带走，在废工厂中搭建的BCST研究室进行身体上的监视。此时行踪不明的怪兽THE ONE像被某种东西吸引而回来了。遭受THE ONE攻击而濒死的真木，身体发生了变化，在红色光球的力量之下变身了！变成身高10M拥有银色光芒的钢铁身体型态，偶而还有自己意志的真木，跟THE ONE展开作战，但是因为变身不完全，能量快速消耗，在遭到决定性的一击后变回了真木舜一的型态。然后沙罗将这个在THE ONE之后出现的生命体定名为“THE NEXT”。　　真木在从东京被护送回BCST研究室的途中得知了儿子继梦入院的消息,在赶到医院后跟妻子蓉子再次的碰面了。此时,人类最大的危机出现了,在吸收了各式各样的生物进入体内而产生变异的THE ONE重返出现在新宿的街道上,从口中发出的的超绝火炎光弹将街道烧毁殆尽有恸的人格已经被THE ONE取代,已经成为不能变回为人的状态。不过那样的有恸以前与水原沙罗却是有着婚约的情侣为了沙罗心中的回忆，并且为了跟儿子继梦的约定，为了保护心爱的家族，真木再次变身。那个姿态更加进化成巨大化40m，在间接部有像流血般的红色，两肘的特征是出现肘刀。现在，以新宿副市中心为舞台，ULTRAMAN与THE ONE的决战之火开始燃烧了！

童年时代家庭四分五裂，长大后与母亲（药师丸博子 饰）关系紧张，整天浪荡社会，惹是生非，无业青年长谷部泰之（二宮和也 饰）好不容易找到一份工作，可是在应聘的前夜却因一场殴斗，逃跑时意外摔伤，导致下半身瘫痪，从此再也无法站立起来，轮椅将成为他毕生的伴侣。新生活还未开始便戛然而止，这令泰之倍感绝望。在心理咨询师南英明（伊势谷友介 饰）、病友以及周遭所有人的鼓励下，泰之积极参加康复训练，并渐渐重拾生活的希望，命运之神重新向他展露笑容…… 　　本片根据心理咨询师长谷川泰三的自传体著作《（生命的咨询）命のカウンセリング》改编。

某大型饮料公司的OL川原由加利（长泽雅美 饰）和男友小出桔平（高桥一生 饰）是一见钟情。原本生活平静，简单幸福，但是这一切都被突如其来的事件所打乱。某天，桔平因蛛网膜下出血突然昏倒，可是随后被医护人员发现，他所持有的驾照、医师执照居然全是伪造的。得知消息的由加利十分震惊，对于这个相处五年之久的男友，竟然自己完全感到陌生。在此之后，由加利请来私家侦探调查桔平，更从男友一份未完成的小说手稿中找到了蛛丝马迹。他是谁？他又为何甘心让自己和爱人活在谎言之中？ 　　本片故事取材自真实事件。